昌赣高铁开通后，铁路部门将安排开行24对赣州西始发列车、3对瑞金始发列车以及8对跨线车。具体如下：
赣州西至南昌（西）列车16对，最快铁路旅行时间1小时43分钟，比普速列车缩短3小时26分；
赣州西至武汉2对，运行时间4小时32分钟，比普速列车缩短6小时36分；
赣州西至郑州东、杭州东、长沙南、南京南、九江、景德镇北各1对，其中赣州至长沙间是首次开行直通车，运行时间4小时11分钟。
瑞金至南昌（西）列车2对，运行时间2小时39分，比普速列车缩短4小时25分；
瑞金至北京西列车1对，运行时间12小时11分，比普速列车缩短12小时4分钟，旅客可以从红色故都乘高铁直达祖国首都。
依托新建昌赣高铁，南铁还开行了厦门至武汉、西安、成都、南昌等方向列车7对，福州至萍乡列车1对。
昌赣高铁开通后，沿线所有车站将推行电子客票。旅客可凭购票时所使用的乘车人有效身份证原件，通过实名制核验、检票闸机自助完成实名制验证、进出站检票等手续，退票改签均可线上办理。
为了让旅客出行更美好，铁路部门在昌赣高铁沿线车站规划设置品牌餐饮、便利店等商业点位32个，设置母婴候车室，预留无障碍绿色通道。
赣州市副市长何富洲表示，昌赣高铁开通必将作为一个重大历史事件载入赣南苏区振兴发展史，对赣州经济社会具有重大而深远的意义。“将进一步促进赣州与周边地区的文化旅游交流和经贸投资合作，极大地推动赣州建设‘一带一路’重要节点城市和对接融入粤港澳大湾区。”
